基于数据挖掘的微生物源追踪的元分析,用于识别水环境中的便污染,基于数据挖掘
Zejun Liu1, Yingying Lin2, Yanhong Ge3
1School of Civil Engineering, Sun Yat-Sen University, Zhuhai, 519082, China; Guangdong Key Laboratory of Integrated Agro-environmental Pollution Control and Management, Institute of Eco-environmental and Soil Sciences, Guangdong Academy of Sciences, Guangzhou, 510070, China.
微生物源追踪 (MST) 起始剂表现出不同的性能. 基于病毒的原料在水中检测人类病原体的特异性优于基于细菌的原料.
科学领域:
- 环境微生物学环境微生物学
- 分子生物学分子生物学
- 评估水质水质的评估.
背景情况:
- 微生物源追踪 (MST) 对于识别水中的便污染至关重要.
- 在MST中的原料表现可以受到放大方法,原料类型和地理位置的影响.
- 了解这些因素是提高水质监测可靠性的关键.
研究的目的:
- 进行元分析,评估影响微生物源追踪 (MST) 的因素,评估水环境中的原料性能.
- 为了比较不同的原料类别,放大技术和检测方法的有效性.
- 评估区域差异对初级识别的影响.
主要方法:
- 我们对来自Web of Science,Scopus和PubMed的2291项研究进行了元分析.
- 选择了46项研究,分析了聚合酶链反应 (PCR) /定量PCR (qPCR),基于染料 (SYBR) /基于探针 (TaqMan) 的技术,以及宿主特异性原料 (HF183和其他21个).
- 评估了原料的灵敏度,特异性和宿主分化能力.
主要成果:
- 所有分析的原料都显示出某种程度的宿主特异性.
- 基于病毒的原料表现出比基于细菌的原料具有更高的特异性和与人类病原性相关性.
- 定量PCR (qPCR) 与传统PCR没有显著的优势;基于探针的方法比基于染料的方法更具特异性,减少了假阳性.
- 在HF183原料中,中国,加拿大和新加坡没有显著的区域异质性.
结论:
- 基于病毒的原料代表了微生物源追踪增强特异性的有希望的方向.
- 建议采用基于探针的检测方法,以提高水传播病原体识别的准确性.
- 料的性能受到包括检测技术,料设计和环境条件在内的复杂因素相互作用的影响.
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