基于生物信息学,识别与铁亡相关的基因作为糖尿病病的潜在诊断生物标志物
Binbin Guo1, Minhui Li2, Peipei Wu1
1International Special Medical Department, Shengli Oilfield Central Hospital, Dongying, Shandong, China.
Frontiers in molecular biosciences
|August 18, 2023
概括
这项研究确定了包括TP53在内的六个与铁亡相关的基因,作为糖尿病病 (DN) 的潜在诊断生物标志物. 使用这些生物标志物的诊断模型在识别DN方面表现出高准确性,TP53可能在疾病发展中发挥关键作用.
科学领域:
- 生物医学研究的研究.
- 基因组学就是基因组学.
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 糖尿病病 (DN) 是糖尿病的严重并发症,其特征是逐渐恶化的损伤.
- 识别可靠的诊断生物标志物和了解DN的潜在分子机制对于有效的管理至关重要.
研究的目的:
- 确定糖尿病病 (DN) 的新型铁亡相关诊断生物标志物.
- 阐明与DNA发育中的这些生物标志物相关的分子机制.
- 根据已识别的生物标志物开发DN的诊断模型.
主要方法:
- 使用GEO数据库数据集 (GSE30122,GSE1009) 来选差异表达的铁亡相关基因 (FRG).
- 应用生物信息学分析包括GO,KEGG,GSEA,PPI,LASSO和SVM-RFE用于基因查和模型开发.
- 在脏组织中使用qRT-PCR和Western blot验证了生物标志物表达;分析了与免疫细胞的生物标志物相关性.
主要成果:
- 确定了51种不同表达的FRG,富含p53信号传导和氧化应激等途径.
- 六个关键生物标志物 (TP53,RB1,NF2,RRM2,PRDX1,CDC25A) 已被确定用于DN诊断,TP53显示了最高的差异表达.
- 一个诊断模型实现了高精度 (AUC 0.939-1.000);五个生物标志物与免疫细胞透有显著的相关性;TP53通过PI3K-AKT信号在DN中促进细胞亡.
结论:
- TP53,RB1,NF2,RRM2,PRDX1和CDC25A是糖尿病病的有希望的诊断生物标志物.
- 开发的诊断模型在DN诊断方面表现出色.
- TP53在DN病原发生中发挥着重要作用,可能通过PI3K-AKT信号通路.
