斑马mbuna中的两个大酶A / K同类具有不同的特异性,一个是经典的试酶,另一个具有基酶活性
Erdem Aybay1, Mamoun Elkhalifa1, Srinivas Akula2
1Department of Cell and Molecular Biology, Uppsala University, The Biomedical Center, Box 596, SE-751 24, Uppsala, Sweden.
Developmental and comparative immunology
|August 19, 2023
概括
大酶A和K是古代的免疫蛋白酶. 在类动物中,新的基酶类型的巨酶进化,其中一个,巨酶A2,表现出严格的基酶活性,与其酶对应物巨酶A1.1不同.
科学领域:
- 进化免疫学的进化免疫学
- 蛋白质酶生物化学 蛋白质酶生物化学
- 进行比较的基因组学.
背景情况:
- 大酶A和K是同源的血清蛋白酶,对细胞毒性T细胞 (CTL) 和自然杀手 (NK) 细胞功能至关重要.
- 大酶A/K位点是古老的,存在于所有的脊椎动物中,但基因拷贝数量因物种而异.
- 哺乳动物的A和K粒酶有不同的作用,尽管A粒酶的确切免疫防御功能尚不清楚.
研究的目的:
- 描述类动物中新型花粉酶家族成员的扩展裂变特异性.
- 为了研究鱼类中大酶A/K蛋白酶的进化分歧.
- 为了比较斑马中古典和非古典粒酶的基质特异性. mbuna.
主要方法:
- 斑马 mbuna granzyme A2 (非经典成员) 的扩展裂变特异性的详细表征.
- 斑马 mbuna granzyme A1 (经典成员) 的表征,以建立一个比较的基线.
- 对基质结合口袋的分析,以推断酶活性 (基酶与酶).
主要成果:
- 斑马 mbuna 大酶A2,位于大酶A/K位点,作为严格的基马酶起作用,在P1位置更喜欢氨酸.
- 斑马 mbuna 大酶A1 作为三酶起作用,在 P1 位置偏爱阿金氨酸.
- 这两种大酶在围绕分裂部位的首选氨基酸中表现出相似之处和差异.
结论:
- 类动物拥有新型的基马酶样大酶,包括A2大酶,其特异性与古典大酶有所不同.
- 鱼类中这些化学酶的存在引发了关于补偿性进化的问题,这些功能通常由哺乳动物的巨细胞化学酶介导.
- 需要进一步的研究来确定类似的化学酶是否已经在其他鱼类中进化.
