通过 MALDI-TOF MS 通过使用新型图书馆 MS 改进了 Streptococcus bovis-Streptococcus equinus 复合物种和亚种的识别
Jonas Öberg1, Malin Inghammar2, Bo Nilson3
1Department of Clinical Sciences Lund, Section for Infection Medicine, Lund University, Lund, Sweden; Department of Infectious Diseases, Helsingborg Hospital, Helsingborg, Sweden.
一个新的内部矩阵辅助激光脱/电离飞行时间质谱 (MALDI-TOF MS) 图书馆显著改善了Streptococcus bovis/Streptococcus equinus-complex (SBSEC) 细菌的识别. 这种增强的库实现了97%的准确性,超过了临床使用的现有商业选择.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 质谱测量质量谱测量
- 临床诊断 临床诊断 临床诊断
背景情况:
- 杆菌bovis/Streptococcus equinus-complex (SBSEC) 是一组细菌,通常与血液感染有关.
- 准确识别SBSEC的物种和亚种对于有效的临床管理和流行病学研究至关重要.
- 现有的识别方法可能在分种层面准确区分SBSEC方面存在局限性.
研究的目的:
- 开发和验证一个内部的矩阵辅助激光消耗/电离飞行时间质谱 (MALDI-TOF MS) 图书馆.
- 加强SBSEC组内物种和亚种的准确识别.
- 在临床环境中提高SBSEC的诊断能力.
主要方法:
- 使用全基因组测序来确定236个SBSEC分离物种的亚种水平.
- 使用布鲁克马尔迪生物型系统获得质谱.
- 创建了一个内部图书馆",SBSEC-CMRS图书馆",使用来自117个隔离物的光谱概况,并与其他119个隔离物进行评估.
主要成果:
- 开发的SBSEC-CMRS库实现了97%的识别率 (116个119个分离物中116个),截止分数≥2.0.
- 商业布鲁克图书馆 (Revision K, 2022) 只有61% (119个分离物中72个) 的相同分离物被正确识别出来.
- 公司内部图书馆在SBSEC识别方面显示出明显更高的诊断准确性.
结论:
- SBSEC-CMRS库是一个非常准确的工具,用于识别SBSEC物种和亚种.
- 该图书馆显示了足够的诊断准确性,用于在常规临床实践中实施.
- 这一发展为临床实验室中SBSEC的识别提供了宝贵的改进.
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