实施和未来实时评估一个通用的系统,用于在诊所部署和验证机器学习模型在放射学
James R Hawkins1, Marram P Olson1, Ahmed Harouni2
1Center for Intelligent Imaging, Department of Radiology and Biomedical Imaging, University of California, San Francisco, California, United States of America.
PLOS digital health
|August 21, 2023
概括
本研究引入了一个可扩展的开源系统,用于临床验证和部署医学成像中的机器学习 (ML) 模型. 该系统解决了工程挑战,使得ML工具在临床工作流程中的高效集成和评估成为可能.
科学领域:
- 医疗成像医学成像
- 机器学习 机器学习
- 临床信息学 临床信息学
背景情况:
- 机器学习 (ML) 在医学成像中的采用正在迅速增加.
- 临床验证和部署ML模型带来了重大的工程和工作流集成挑战.
- 现有的系统往往缺乏针对各种ML应用的通用性和可扩展性.
研究的目的:
- 为ML模型部署和验证提供一个通用,端到端,临床集成的系统.
- 详细说明在实施过程中遇到的工程和可用性挑战.
- 为寻求在临床环境中翻译和验证ML模型的机构提供一个模板.
主要方法:
- 开发了一个使用开源软件 (OSS) 的通用验证系统.
- 集成的临床成像模式,图片存档和通信系统 (PACS),以及一个ML推断服务器.
- 使用了NVIDIA的Clara Deploy用于ML管道和一个定制的XNAT实例用于结果和反存储.
- 对三种ML模型进行了前性临床验证研究.
主要成果:
- 成功实施了一个连接成像模式,PACS和ML推断的系统.
- 收集专家对模型性能,可用性和系统可靠性的临床反.
- 通过三个用例证明了系统可靠性和性能指标.
- 强调工程师,临床医生和数据科学家之间的合作的重要性.
结论:
- 机器学习模型的临床验证需要评估性能,基础设施影响,稳定性和可用性.
- 一种模块化,基于OSS的方法促进了系统的泛化和可扩展性.
- 开发的系统为临床ML翻译提供了一个实用的模板,概述了资源和挑战.
- 成功的ML集成需要协调,多学科的努力.
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