多重复合免疫组织化学分析瘤微环境的空间免疫细胞景观
Mark A J Gorris1, Evgenia Martynova2, Mark W D Sweep3
1Department of Medical BioSciences, Radboudumc; Division of Immunotherapy, Oncode Institute, Radboudumc; mark.gorris@radboudumc.nl.
Journal of visualized experiments : JoVE
|August 22, 2023
概括
这项研究详细介绍了使用多重免疫组织化学和机器学习分析瘤组织中的免疫细胞的协议. 这些方法允许精确的免疫细胞分析,用于生物标志物发现和潜在的诊断应用.
科学领域:
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 在瘤学瘤学.
- 生物标志物发现发现
背景情况:
- 瘤微环境的免疫细胞组成对于预后和预测生物标志物发现至关重要.
- 多重免疫组织化学 (IHC) 对于可视化组织架构中的免疫细胞至关重要.
- 免疫细胞的空间信息为瘤生物学提供了洞察力.
研究的目的:
- 提供详细的协议,用于分析组织部分的免疫细胞群.
- 在各种瘤类型中建立免疫细胞分析工作流.
- 促进这些方法在诊断环境中的应用.
主要方法:
- 使用甲固定嵌 (FFPE) 组织截面.
- 在自动化平台上使用自动化多重染色.
- 用多光谱成像显微镜扫描幻灯片.
- 用ImmuNet机器学习算法分析图像.
主要成果:
- 详细介绍了分析淋巴细胞,骨髓细胞和树突细胞群的详细方案.
- 该工作流允许在不同的组织区 (瘤与侵入边缘) 中分析免疫细胞.
- 邻近分析可以应用于各种组织类型,而不仅仅是瘤.
结论:
- 开发的协议提供了FFPE组织中免疫细胞分析的综合方法.
- 该工作流适应不同类型的瘤,并可应用于非致病性组织.
- 精简的吞吐时间支持未来整合到常规诊断中.
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