儿科低度质瘤的非侵入性分子亚型与自我监督的转移学习
Divyanshu Tak1,2, Zezhong Ye1,2, Anna Zapaishchykova1,2
1Artificial Intelligence in Medicine (AIM) Program, Mass General Brigham, Harvard Medical School, Boston, MA, USA.
medRxiv : the preprint server for health sciences
|August 23, 2023
概括
这项研究开发了一种使用转移学习和自我监督交叉训练的深度学习管道,以从MRI扫描中准确预测儿科低度质瘤 (pLGG) 中的BRAF突变状态.
科学领域:
- 神经瘤学神经瘤学
- 医疗成像医学成像
- 人工智能的人工智能
背景情况:
- 儿科低度结质瘤 (pLGG) 经常含有BRAF突变,影响治疗决策.
- 准确的BRAF突变状态的非侵入性分类对于个性化治疗至关重要.
- 目前的方法可能需要侵入性程序或缺乏全面的预测能力.
研究的目的:
- 开发和验证一个深度学习管道,用于pLGG中基于MRI的BRAF突变状态的非侵入性分类.
- 为了将BRAF突变状态分类为V600E,融合或野生类型的类别.
- 提高预测模型的概括性和解释性.
主要方法:
- 一个回顾性研究使用了两个pLGG数据集与链接的基因组和T2权重的MRI数据.
- 一个两阶段的深度学习管道涉及3D瘤细分和切片分类.
- 研究了知识转移和自我监督方法 (TransferX),以防止过度拟合.
主要成果:
- 在内部验证中,TransferX模型实现了0.82的宏观平均AUC和77%的准确性.
- 外部验证显示AUC为0.73且准确率为75%.
- 一个新的指标,COMDist,被开发来量化模型的注意力准确性.
结论:
- 转移学习和自我监督的交叉培训提高了对非侵入性PLGG BRAF突变状态预测的分类性能.
- 开发的管道在有限的数据场景中显示出希望.
- 这种方法提供了一种非侵入性的方法来预测pLGG BRAF状态,有助于治疗计划.
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