细菌和线粒体qPCR源追踪方法的性能:一项欧洲多中心研究
Sílvia Monteiro1, Bernardino Machado-Moreira2, Rita Linke3
1Laboratório de Análises, Instituto Superior Técnico, Universidade de Lisboa, Av. Rovisco Pais 1, 1049-001, Lisboa, Portugal; CERIS, Instituto Superior Técnico, Universidade de Lisboa, Av. Rovisco Pais 1, 1049-001, Lisboa, Portugal; Departamento de Engenharia e Ciências Nucleares, Instituto Superior Técnico, Universidade de Lisboa, EN. 10, 2695-066, Bobadela, Portugal.
International journal of hygiene and environmental health
|August 23, 2023
概括
这项研究评估了欧洲各地用于便源追踪 (ST) 的九项定量PCR (qPCR) 试验. 结果显示,这些分子分析具有很高的灵敏度和特异性,用于识别水中的人类和动物便污染.
科学领域:
- 环境微生物学环境微生物学
- 分子诊断学 分子诊断学
- 评估水质水质的评估.
背景情况:
- 定量PCR (qPCR) 试验对于便源追踪至关重要,但它们的特异性和敏感性各不相同.
- 之前的ST研究往往是区域性的,使用有限的测试,阻碍了精确的污染源识别.
- 需要一个多中心的欧洲研究,以全面比较细菌和线粒体qPCR测定ST.
研究的目的:
- 评估九个已建立的人类,牛/反动物,猪和家禽便污染的qPCR试验的效率和性能.
- 为了比较细菌和线粒体分子测试,以确定它们在源追踪中的准确性.
- 在各种环境样本中评估ST qPCR标记物的地理适用性.
主要方法:
- 一项涉及五个欧洲国家的多中心研究分析了77个样本,包括动物便泥和人类/非人类废水.
- 使用基于培养的方法和九种不同的qPCR测定方法测量了七个便指标.
- 针对人类,牛/反动物,猪和家禽相关的便污染进行评估,评估灵敏度和特异性.
主要成果:
- 便指标在样本中无处不在,通过培养和qPCR检测到.
- 大多数ST qPCR标记物表现出高量的敏感性 (73%-100%) 和特异性 (53%-97%),表明其广泛的地理实用性.
- 与动物相关的标记物通常在比人类相关的标记物更高的度下被检测出来,其中包括Bacteroides spp. 和线粒体DNA的qPCR标记物表现出强的性能.
结论:
- 细菌和线粒体qPCR测定是水生环境中先进污染监测的有效工具.
- 这些ST标志物支持制定有针对性的水质管理策略.
- 该研究强调了利用分子方法改善分化便污染源的潜力.
