通过QTL和PACE分析,可以在番茄中识别出对毒素耐药性的候选基因
Carlos Lopez-Ortiz1, Umesh K Reddy1, Chong Zhang2
1Department of Biology, Gus R. Douglass Institute, West Virginia State University, Institute, WV, United States.
Frontiers in plant science
|August 24, 2023
概括
研究人员确定了20个定量特征位点 (QTLs) 对于西红的抗甲基. 这些发现为开发耐药品种铺平了道路,减少了杀真菌剂的使用和这种重大疾病造成的作物损失.
科学领域:
- 植物病理学 植物病理学
- 遗传学 是一个遗传学.
- 农业科学 农业科学
背景情况:
- 由*Colletotrichum* spp.引起的红病是全球主要的西红疾病.
- 缺乏商业上可用的耐药品种阻碍了育种工作,并增加了对杀菌剂的依赖.
- 开发耐药番茄品种对于减少作物损失和化学应用至关重要.
研究的目的:
- 为了确定与西红中抗人类毒素相关的定量特征位点 (QTLs).
- 开发用于高通量查的工具,以加快抗人类毒素耐药性的育种.
主要方法:
- 一个重组杂交线 (RIL) 种群 (N=243) 由易受 (US28) 和耐药 (95L368) 番茄系之间的交叉生成.
- 现型化包括在两个季节内用*Colletotrichum coccodes*对成熟的西红果实进行注射.
- 使用骨链接地图,全基因组协会研究 (GWAS) 和QTLseq分析确定了定量特征位置 (QTLs).
主要成果:
- 确定了20个赋予人类毒素耐药性的QTLs,解释了4.5%至17.2%的表型变异.
- QTLseq分析验证了QTL位置并确定了候选基因.
- 关键的候选基因,包括转录因子和抗病蛋白,通过PACE基因定型验证.
结论:
- 这项研究成功地确定了多个QTL用于西红中抗炭素的耐药性.
- 开发的PCR等位基竞争扩展 (PACE) 试验使得能够有效选抗人类毒素耐药性繁殖.
- 这些进展将有助于开发抗炭毒的番茄品种.
