数字-scRRBS:一个成本效益高,高度灵敏,并通过数字微流体自动化单细胞甲基组分析平台
Xi Zeng1, Xiaoxu Guo1, Shaowei Jiang1
1The MOE Key Laboratory of Spectrochemical Analysis & Instrumentation, the Key Laboratory of Chemical Biology of Fujian Province, State Key Laboratory of Physical of Chemistry of Solid Surfaces, Collaborative Innovation Center of Chemistry for Energy Materials, Department of Chemical Biology, Department of Chemical Engineering, College of Chemistry and Chemical Engineering and Institute of Artificial Intelligence, Xiamen University, Xiamen 361005, China.
Analytical chemistry
|August 24, 2023
概括
我们开发了基于数字微流体的单细胞减少表示二硫酸盐测序 (digital-scRRBS),这是一种用于高效单细胞甲基组分析的新平台. 这种技术可以为罕见和异质细胞群进行精确的DNA甲基化分析.
科学领域:
- 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.
- 基因组学就是基因组学.
- 生物技术是生物技术.
背景情况:
- 单细胞DNA甲基化测序对于理解细胞异质性和表观遗传调节至关重要.
- 目前的方法受到高成本,复杂性和大量起始材料要求的限制.
研究的目的:
- 开发一个自动化,高效和试剂节约的平台,用于单细胞甲基组库的构建.
- 克服现有的单细胞甲基组分析技术的局限性.
主要方法:
- 实施数字微流体芯片,以快速隔离单细胞.
- 基于数字微流体的单细胞减少表示双硫酸盐测序 (数字-scRRBS) 协议的开发.
主要成果:
- 成功构建单细胞甲基化测序库,具有高的独特基因组映射率 (高达53.6%).
- 每个单元覆盖多达226万个CpG位点.
- 在药物管理过程中证明了区分细胞身份和跟踪DNA甲基化变化的能力.
结论:
- 数字-scRRBS是第一个基于微流体的平台,用于单细胞甲基组库的构建.
- 这种技术是自动化的,有效的,可重复的,试剂效率高的.
- 数字-scRRBS扩大了为罕见和异质细胞群的单细胞甲基化分析的应用.
