碰撞横截面测量和预测方法在omics中的方法
Kimberly Y Kartowikromo1, Orobola E Olajide1, Ahmed M Hamid1
1Department of Chemistry and Biochemistry, Auburn University, Auburn, Alabama, USA.
Journal of mass spectrometry : JMS
|August 24, 2023
概括
碰撞横截面 (CCS) 测量对于在奥米克学研究中识别化合物至关重要. 本综述涵盖了CCS估计的实验和理论方法,解决了准确阐明化合物结构的局限性和解决方案.
科学领域:
- 分析化学 分析化学
- 生物化学 生化学
- 结构生物学 结构生物学
背景情况:
- 欧米学研究 (代谢学,脂质学,蛋白质学) 需要精确的化合物识别.
- 结构异构体产生不同的生物作用,需要精确的结构阐明.
- 液体染色学-质谱学 (LC-MS) 是至关重要的,但在区分异构体方面存在局限性.
研究的目的:
- 提供对估计碰撞横截面 (CCS) 值的实验和理论方法的概述.
- 讨论当前CCS估计方法的局限性.
- 探索这些限制的潜在缓解策略.
主要方法:
- 实验性CCS测量 (依赖校准剂和独立方法).
- 理论CCS预测 (计算和机器学习模型).
- 审查关于CCS估计技术的现有文献.
主要成果:
- 离子移动性光谱学为化合物提供了独特的指纹 (CCS).
- 准确的CCS值有助于过潜在的分析物结构.
- 实验性CCS需要标准,这些标准是有限的;理论预测对于非目标分析至关重要.
结论:
- CCS是一个强大的工具,用于化合物识别和结构阐明在奥米克.
- 实验和理论CCS估计方法都有局限性.
- 为了更广泛的应用,需要进一步开发理论模型和实验标准化.
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