通过结合下一代测序与反射节基因融合试验试验,有效地进行肺癌分子诊断
Dingani Nkosi1, Giby V George1, Huijie Liu1
1Department of Pathology and Laboratory Medicine, School of Medicine & Dentistry, University of Rochester, Rochester, NY 14642, USA.
Genes
|August 26, 2023
概括
优化肺癌分子诊断包括使用小基因下一代测序 (sNGS) 面板和快速反射测试. 这种方法为大多数情况下提供了具有成本效益的解决方案,并为复杂突变提供了选择.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 分子诊断学 分子诊断学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 分子诊断对于肺癌的治疗至关重要,但最佳和经济有效的工具利用仍然是一个挑战.
- 目前的分子测试策略需要改进,以平衡全面性和效率.
研究的目的:
- 评估一个具有成本效益和全面的分子诊断策略,用于肺癌.
- 为了确定小基因下一代测序 (sNGS) 面板与反射融合转录测试相结合的实用性.
主要方法:
- 使用只有DNA的小基因下一代测序 (sNGS) 面板 (<50个基因).
- 通过Idylla Genefusion测试,对常见的融合转录进行了超快速反射测试.
- 评估了对罕见变异和耐药性突变进行更广泛的反射测试的需要.
主要成果:
- 对于大多数肺癌患者来说,sNGS和快速反射融合测试的组合被证明是具有成本效益和全面的.
- 肺癌的一个子集需要在更大的面板上进行额外的反射测试,以检测罕见的变异,内置,融合和耐药性突变.
- 拟议的工作流适用于其他固体瘤.
结论:
- 使用sNGS和反射检测的综合分子测试为肺癌诊断提供了一种高效和成本效益的方法.
- 一个分层的反射测试策略是必要的,以解决少数肺癌病例的基因组复杂性.
- 这个工作流可以扩展到其他固体瘤类型,以进行全面的基因组分析.
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