深度神经网络和分子对接支持了prometryn的毒性概况
Feride Çakir1, Fatih Kutluer2, Emine Yalçin3
1Department of Biology, Institute of Science, Giresun University, Giresun, Turkiye.
Chemosphere
|August 26, 2023
概括
普罗米特林除草剂会在洋细胞中引起氧化应激和基因毒性,导致生长减缓. 深度神经网络 (DNN) 模型准确预测这些有害影响,帮助可持续农业.
科学领域:
- 环境毒理学环境毒理学
- 植物科学 植物科学
- 生物化学 生物化学
背景情况:
- 普罗米特林是一种广泛使用的除草剂,具有潜在的环境影响.
- 了解其毒性机制对于农业安全至关重要.
- (Allium cepa) 是一种敏感的模型生物体,用于基因毒性测试.
研究的目的:
- 为了研究 prometryn 对 Allium cepa 的基因毒性和生化作用.
- 探索prometryn-DNA相互作用和诱导氧化应激的潜力.
- 开发和验证深度神经网络 (DNN) 模型,用于预测普罗美特林的毒性.
主要方法:
- 用不同度的prometryn (200-800 mg/L) 处理了Allium cepa的种子.
- 评估了细胞遗传学 (微核,染色体异常),生化学 (氧化应激标志物) 和生理学参数.
- 分子对接和彗星测试被用来评估DNA相互作用和损伤.
- 一个深度神经网络 (DNN) 模型被训练来预测毒性终点.
主要成果:
- 普罗米特林诱导了显著的氧化应激,由改变的抗氧化酶活性和脂质过氧化证明.
- 观察到基因毒性影响,包括线粒体指数下降和染色体异常增加.
- 普罗米特林治疗导致DNA碎片化,并通过分子对接证明与DNA基的相互作用.
- 发芽,根长度和最终重量等生理参数显著减少.
- 开发的DNN模型准确地预测了prometryn对基因毒性生物标志物的影响.
结论:
- 普罗米特林在Allium cepa.中表现出显著的基因毒性和氧化应激诱导性质.
- 这项研究强调了普罗米特林可能通过直接相互作用和氧化应激引起DNA损伤的潜力.
- 经过验证的DNN模型是预测除草剂毒性和支持可持续农业实践的有希望的工具.
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