一个精简的指导RNA查系统用于基因组编辑在Sorghum双色球
Jeong Sun Lee1,2,3, Su-Ji Bae1, Jin-Soo Kim4
1Center for Genome Engineering, Institute for Basic Science, Daejeon, Republic of Korea.
Plant methods
|August 26, 2023
概括
一个新的CRISPR查系统有效地评估单向导RNA (sgRNA) 活性,用于小麦基因组编辑. 这种快速方法通过快速识别针对向突变的有效sgRNA来加速作物改进.
科学领域:
- 植物生物技术 植物生物技术
- 分子生物学分子生物学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- CRISPR-Cas系统为有针对性的植物基因组编辑提供了强大的工具.
- 单向导RNAs (sgRNAs) 的可变效率阻碍了快速的作物改善.
- 需要有效的方法来评估植物中的sgRNA活性.
研究的目的:
- 开发和优化快速选系统,以评估在基因组编辑中的sgRNA效率.
- 为了比较不同CRISPR传递方法 (等离子体与RNP) 在原生体中.
- 为了建立最佳的条件为原生质的隔离和转染.
主要方法:
- 开发了一种短暂的原生质细胞转染试验,用于.
- 优化了 sorghum 植物的种植,以隔离高产原生质.
- 利用聚乙烯糖醇介导的转染来提供CRISPR组件.
- 通过针对性的深度测序分析了indel频率.
主要成果:
- 优化的种植条件产生了大量具有高效转染的可活原塑.
- 通过等离子体介导的输送达到了77.8%的内置频率,而RNP输送达到了18.5%.
- 整个查过程在16天内完成.
结论:
- 开发的sgRNA查系统是高效和简单的,用于的基因组编辑.
- 这种系统大大减少了作物改进所需的时间和资源.
- 预测sgRNA活动的早期预测加速了基因编辑果品种的发展.
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