用于识别病原体特异性循环DNA的元基因组测序,以及开发用于杆菌病的诊断方法
Jingyi Liu1,2, Xiaoxu Wang3, Fei Sheng1
1Shanghai Tenth People's Hospital, Tongji University School of Medicine, #500 Zhen-nan Road, Shanghai 200331, People's Republic of China.
iScience
|August 28, 2023
概括
早期检测 Schistosoma japonicum 感染是非常重要的. 新的循环DNA生物标记物和CRISPR-Cas12a和RPA-LF等快速诊断方法显示出对人类和动物及时诊断的希望.
科学领域:
- 寄生虫学的寄生虫学
- 分子生物学分子生物学
- 传染性疾病 传染性疾病
背景情况:
- 及时诊断schistosoma感染对于有效控制至关重要.
- 早期发现有助于迅速治疗和公共卫生干预.
- 目前的诊断方法可能对早期感染的敏感度或速度有局限性.
研究的目的:
- 为了识别病原体特定的循环DNA (cDNA) 对于 Schistosoma japonicum 感染.
- 开发新的,快速的诊断方法,用于早期阶段的杆菌病.
- 在动物模型和人类应用中评估已识别的cDNA的诊断潜力.
主要方法:
- 基因组下一代测序 (mNGS) 用于识别受感染子血清中的cDNA.
- 使用聚合酶链反应 (PCR) 和定量PCR (qPCR) 验证已识别的cDNA.
- 基于循环介导同热放大 (LAMP) 的CRISPR-Cas12a和基于再组合聚合酶放大的侧向流带 (RPA-LF) 测试的开发.
主要成果:
- 在受感染的子血中发现了22个Schistosoma japonicum特异性的cDNA.
- 开发的基于LAMP的CRISPR/Cas12a和RPA-LF方法成功检测到感染.
- 这些新的方法证明了在感染后5天以低剂量的寄生虫 (5 cercariae) 诊断小鼠和人类杆菌病的潜力.
结论:
- 循环中的 Schistosoma japonicum 特定的 cDNA 作为有效的生物标志物用于感染检测.
- 开发出来的分子诊断工具为早期的schistosoma检测提供了一个有希望的途径.
- 这些进展可以显著改善杆菌病的监测和控制策略.
