基因签名显示,免疫检查点抑制剂耐药性皮肤黑色素瘤的恶性细胞中的SOX10依赖转录减少
Timothy J Purwin1,2, Signe Caksa1, Ahmet Sacan2
1Department of Pharmacology, Physiology, and Cancer Biology, Thomas Jefferson University, Philadelphia, PA 19107, USA.
iScience
|August 28, 2023
概括
黑色素瘤中SOX10表达的减少与针对性激酶抑制剂和免疫检查点抑制剂的耐药性相关. 这表明缺乏SOX10的细胞可能会驱动交叉抵抗,需要新的治疗策略.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 分子生物学分子生物学
- 免疫学 免疫学 免疫学
背景情况:
- 免疫检查点抑制剂 (ICI) 和向激酶抑制剂之间的交叉耐药性在皮肤黑色素瘤中越来越令人担忧.
- 转录因子SOX10的损失与对MAPK路径抑制剂的抵抗有关.
研究的目的:
- 调查SOX10表达/活性降低与黑色素瘤中ICI耐药性之间的关联.
- 开发和验证SOX10基因特征作为SOX10依赖活性的生物标志物.
主要方法:
- 来自黑色素瘤细胞模型的SOX10 ChIP-seq,淘汰RNA-seq和淘汰ATAC-seq数据的生物信息集成.
- 在独立数据集中计算验证SOX10签名,包括单细胞和散装RNA-seq,细胞系面板和耐药模型.
- 对患者单细胞RNA-seq数据的分析,以评估ICI耐药瘤中的SOX10依赖转录水平.
主要成果:
- 一个强大的SOX10基因签名被开发和验证为SOX10依赖活性的衡量标准.
- 在免疫检查点抑制剂耐药黑色素瘤瘤中观察到较低水平的SOX10依赖转录.
- SOX10 缺乏与针对性和免疫检查点治疗的交叉耐药性有关.
结论:
- 缺乏SOX10的黑色素瘤细胞有助于向治疗和ICI之间的交叉耐药性.
- 针对缺乏SOX10的黑色素瘤亚种群可能是一个新的治疗策略.
- 需要进一步的研究来开发针对这种抗性黑色素瘤子组的有效治疗方法.
