质母细胞瘤的存活率与化学辐射后在大型蛋白质组面板中的明显蛋白质组变异标志有关
Andra Valentina Krauze1, Michael Sierk2, Trinh Nguyen2
1Radiation Oncology Branch, Center for Cancer Research, National Cancer Institute, NIH, Bethesda, MD, United States.
Frontiers in oncology
|August 28, 2023
概括
在治疗前和治疗后对质母细胞瘤 (GBM) 血清的蛋白质组分析显示,与患者存活率相关的明显蛋白质变化. 这些发现为非侵入性GBM分类和理解治疗反应提供了潜力.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 蛋白质组学是指蛋白质组学.
- 生物标志物发现发现
背景情况:
- 质母细胞瘤 (GBM) 是一种侵略性的,致命的脑瘤.
- 蛋白质组分析为GBM分类和理解治疗反应提供了一种非侵入性的方法.
研究的目的:
- 分析患者血清样本在并发化疗照射 (CRT) 之前和之后的差异性蛋白质基因表达.
- 通过整合临床和蛋白质学参数来探索蛋白质学变化并对GBM进行分类.
主要方法:
- 来自82名GBM患者的血清样本在CRT前和后使用SOMAScan®蛋白质组测定进行了分析.
- 统计分析包括总生存期 (OS) 的考克斯模型,主要成分分析 (PCA),差异蛋白质表达的配对t测试和基因组丰富分析 (GSEA).
- 权重基因相关性网络分析 (WGCNA) 和Enrichr用于途径验证.
主要成果:
- 确定了三个不同的临床集群,具有差异性存活率.
- 在治疗前和治疗后发现389种明显差异表达的蛋白质 (DEP),其中284种是上调的,105种是下调的.
- 蛋白质组变化,特别是在脂肪酸代谢和TNFα信号传导等途径中,区分了生存组,其中5种蛋白质被确定为OS的统计学上显著的预后因素.
结论:
- 与癌症特征 (进展,抗性,干性,入侵) 相关的明显的蛋白质变化被确定在GBM患者的血清CRT后,与临床生存相关.
- 该蛋白质组有可能用于质瘤的分类和癌症途径的生物质询.
