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Updated: Jul 18, 2025
08:23
Single Cell Transcriptional Profiling of Adult Mouse Cardiomyocytes
Published on: December 28, 2011
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·Cis-Cardio:一个全面的分析平台,用于人类和老鼠的心血管相关的cis-regulation
Chao Song1,2,3,4,5, Yuexin Zhang1,2,3,4,5, Hong Huang1,2,3,5,6
1The First Affiliated Hospital, Institute of Cardiovascular Disease, Hengyang Medical School, University of South China, Hengyang, Hunan 421001, China.
Molecular therapy. Nucleic acids
|August 28, 2023
概括
Cis-Cardio是一个新的网络服务器,它对与心血管相关的 cis-regulatory 数据进行了目录. 它提供分析工具,以了解心血管疾病中的基因调节机制.
科学领域:
- 基因组学就是基因组学.
- 分子生物学分子生物学
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 基因调节元素对于基因表达控制和心血管疾病机制至关重要.
- 要了解这些复杂的疾病,需要大规模的cis-regulatory数据.
研究的目的:
- 开发Cis-Cardio,这是一个新的网络服务器,用于与心血管相关的cis-regulatory数据.
- 提供分析心血管疾病中cis调节的工具.
主要方法:
- 从1,013个人类和小鼠表观遗传数据集中收集和目录了超过4500万个基因组区域.
- 集成的ATAC-seq,DNase-seq,ChIP-seq (基因组,TF/TcoF,RNA Pol,Cohesin) 数据. 这是一个很好的方法.
- 开发了六种分析工具,包括区域重叠,监管丰富和变体解释.
主要成果:
- Cis-Cardio拥有广泛的cis-regulatory数据和详细的注释.
- 该平台提供了全面的CIS监管分析工具.
- 包括超强增强剂,TFBS,SNP,eQTL,DHS和3D染色体相互作用.
结论:
- Cis-Cardio是研究心血管疾病调节机制的宝贵资源.
- 有助于阐明和分析心血管生物学中的 cis 调节元件.
- 为研究人员提供免费可访问的平台.
