统一的老鼠和人类脏单细胞表达图谱揭示疾病状态的共同点和差异
Jianfu Zhou1,2,3,4, Amin Abedini1,2,3,4, Michael S Balzer1,2,3,4
1Renal, Electrolyte, and Hypertension Division, Department of Medicine, Perelman School of Medicine, University of Pennsylvania, Philadelphia, Pennsylvania.
Journal of the American Society of Nephrology : JASN
|August 28, 2023
概括
这项研究创建了一个小鼠细胞图谱,揭示了细胞类型分数驱动大量基因表达变化. 虽然单细胞变化是特定于模型的,但在小鼠病模型和人类糖尿病病模型中,通路水平的变化是保留的.
科学领域:
- 脏生物学和病理学
- 基因组学和转录基因组学
- 翻译医学是一种翻译医学.
背景情况:
- 鼠标模型对于了解病机制和帮助药物发现至关重要.
- 缺乏对现有的小鼠病模型进行系统分析和比较.
研究的目的:
- 在基因表达水平上系统分析和比较18种小鼠病模型.
- 为了比较来自小鼠和人类糖尿病病 (DKD) 的单细胞基因表达数据.
主要方法:
- 从18个小鼠病模型中分析单细胞RNA测序和批量基因表达数据.
- 来自小鼠DKD模型的单核RNA测序数据与人类DKD和健康对照数据的比较.
主要成果:
- 创建了一个包括近30万个细胞的小鼠脏单细胞地图.
- 细胞分数的变化显著影响了大量的基因表达差异.
- 路径级基因表达变化在不同的小鼠病模型和小鼠与人类的DKD之间得到保留,尽管单细胞基因表达的重叠有限.
结论:
- 细胞异质性在驱动病模型中的大量基因表达变化中起着关键作用.
- 在小鼠模型和人类患者之间的单细胞基因表达中存在有限的重叠.
- 保存的途径水平变化为病的跨物种转化研究提供了潜力.
