抽样组合能够快速扩大SARS-CoV-2社区测试的高吞吐量能力

科学领域:

• 病毒学 病毒学
• 公共卫生 公共卫生
• 实验室医学 实验室医学

背景情况:

• 在COVID-19大流行期间,测试能力的快速提升带来了重大挑战.
• 在高通量实验室中实施样本聚合被过程调整的需要所阻碍.

研究的目的:

• 评估源 (抽样) 聚合用于SARS-CoV-2检测的有效性.
• 在现实社会环境中,将抽样组合与个体qRT-PCR测试进行比较.
• 评估使用现有的高吞吐量管道进行聚合测试的可行性.

主要方法:

• 使用抽样组合测试了两个队列:Pool10 (10个样本/组) 和Pool6 (6个样本/组).
• 对一致性,灵敏度,特异性和Ct值差异的分析与个人测试作为参考进行.
• 该研究使用了现有的高通量测试管道,没有修改.

主要成果:

• 抽样组合显示出高一致性,灵敏度和特异性,与单个测试相比,只有边际准确性损失.
• 池10:98.1%的一致性,95.7%的灵敏度,100.0%的特异性. 池6:97.2%的一致性,97.5%的敏感性,96.4%的特异性.
• 当仅考虑病毒度> 400副本/毫升 (Ct < 30) 的样本时,观察到对99.5%的敏感性增加.

结论:

• 抽样组合是一种高度敏感和特定的SARS-CoV-2检测方法.
• 高通量实验室可以立即实施抽样聚合,提高流行病的准备.
• 这种方法为未来的流行病期间的实验室容量提供了一个可扩展的解决方案.