基于废水的尼日尔抗菌素耐药性的监测:一项探索性研究

科学领域:

• 环境微生物学环境微生物学
• 公共卫生监督是对公共卫生的监督.
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• 抗菌素耐药性 (AMR) 是一个日益增长的全球健康威胁.
• 基于废水的监测提供了针对AMR的人口级监测策略.
• 现有的基础设施,如脊髓灰质炎监测,可以被潜在地用于更广泛的健康监测.

研究的目的:

• 探索元基因组学在废水中评估抗菌素耐药性的实用性.
• 分析尼日尔随时间,季节和地区的AMR趋势.
• 评估不同抗生素耐药性基因之间的相关性.

主要方法:

• 在尼日尔 (2016-2019) 储存的48个废水样本上利用了深度元基因组测序.
• 分析了通过国家脊髓灰质炎监测计划收集的未经处理的废水样本.
• 在不同的抗生素类别,季节和地点比较抗药性基因的正常化读数.

主要成果:

• 观察到耐药性决定因素的时间变化:醇减少,而氨基库马林,诺基诺和β-乳酸盐增加.
• 与干旱季节相比,在雨季后的季节,硫胺耐药性明显高.
• 确定了几类抗生素的遗传决定因素之间的正相关性,这表明了共同选择.

结论:

• 应用于废水的甲基因组学是监测AMR的可行工具,在已建立监测计划的环境中.
• 利用尼日尔现有的脊髓灰质炎监测基础设施可以提供有关人口水平AMR的宝贵见解.
• 这些发现突显了废水中AMR的动态性质以及持续监测的必要性.