来自瑞典牛子临床乳腺炎病例的葡萄球菌染色体和葡萄球菌模拟体的基因型特征

科学领域:

• 兽医微生物学 兽医微生物学
• 牛的传染病 牛的传染病
• 基因组学和生物信息学

背景情况:

• 葡萄球菌染色体和葡萄球菌模拟体是牛乳内感染 (IMI) 的关键病原体,特别是亚临床乳腺炎.
• 对于乳牛中这些物种内的基因型多样性,抗菌素耐药性 (AMR) 和毒性因子 (pVF) 的理解有限.
• 研究基因型变异对于了解感染持久性和宿主炎症反应至关重要.

研究的目的:

• 执行S. 染色体和S. simulans从瑞典母乳母牛中分临床乳腺炎中分离的乳液的全基因组测序.
• 为了分析基因型变异,识别AMR和pVF基因,并评估它们与持续性IMI和部炎症的关系.
• 为了阐明这些葡萄球菌种在乳牛群中的流行病学和遗传关系.

主要方法:

• 全基因组测序用于105种S.染色体和118种S.simulans分离物.
• 基因定型包括S.染色体的7位元多位元序列定型 (7-MLST) 和两种物种的核心基因组分析.
• 在化分析中,确定了与抗菌素耐药性 (AMR) 和潜在毒性因子 (pVF) 相关的基因.

主要成果:

• 在S.染色体中确定了47种序列类型 (ST) 和7个核心基因组群,其中ST-6和ST-109是最常见的.
• 在两种物种中观察到大量的基因型变异,有证据表明特定基因型的群体间和群体内传播.
• 在22%的S.染色体分离物中检测到blaZ基因 (β-乳糖酶),主要是在特定的ST中,但不在S.simulans中. 在S. chromogenes亚型之间注意到了pVF概况和炎症反应的差异,但不是S. simulans亚型.

结论:

• 这项研究为S. 染色体和S. 模拟体引起牛乳腺炎的基因组多样性和流行病学提供了新的见解.
• 在S.染色体内的基因型变异与感染持久性和炎症反应有关,表明亚型特定的致病性.
• 这些发现对针对性预防策略和针对由这些葡萄球菌种引起的牛乳腺炎的抗菌治疗决定有影响.