在废水样本中开发和验证双重RT-qPCR测定用于诺罗病毒定量化的双重RT-qPCR测定
Natasha Alex-Sanders1, Nick Woodhall1, Kata Farkas1
1School of Natural Sciences, Bangor University, Bangor, Gwynedd LL57 2UW, UK.
Journal of virological methods
|August 29, 2023
概括
本研究介绍了一种新的,灵敏且具有成本效益的双重RT-qPCR方法,用于在废水中检测诺罗病毒 (NoV) GI和GII. 这种基于废水的流行病学工具有助于跟踪病毒爆发和监测公共卫生.
科学领域:
- 环境微生物学环境微生物学
- 病毒学 病毒学
- 公共卫生 公共卫生
背景情况:
- 诺罗病毒 (NoV) 导致严重的疫情和死亡,临床监测往往不足.
- 基于废水的流行病学 (WBE) 为追踪病毒爆发提供了一个有希望的方法.
- 准确而敏感的病毒量化方法对于有效的WBE至关重要.
研究的目的:
- 开发一种单步双重RT-qPCR试验,用于同时检测诺罗病毒基因组GI和GII.
- 评估废水样本中测试的灵敏度,特异性和潜在抑制.
主要方法:
- 开发一个单步双重反转录定量PCR (RT-qPCR) 试验.
- 测试测试的检测极限 (LOD) 对NoV GI和GII.
- 评估NoV GI和GII目标之间的潜在相互作用,以及废水矩阵组件的抑制.
主要成果:
- 双重RT-qPCR测定表明LODs很低:NoV GI的0.52gc/μl和NoV GII的1.37gc/μl.
- 在NoV GI和GII目标之间没有观察到显著的度依赖相互作用.
- 由于废水有机物质,观察到最小的抑制 (高达32%),双重和单重性能之间没有显著差异.
结论:
- 开发的双重RT-qPCR测定方法对于在废水中检测NoV GI和GII具有敏感性,时间效率和成本效益.
- 这种测量可以成为WBE和诺罗病毒公共卫生监测的宝贵工具.
- 该方法支持环境监测和病毒爆发的早期检测.
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