结直肠癌患者便样本的多omics分析 埃及患者:试点研究
Randa H Khattab1, Rana H Abo-Hammam2, Mohammed Salah3
1Department of Microbiology and Immunology, Al-Salam University, Tanta, Egypt.
BMC microbiology
|August 29, 2023
概括
这项研究比较了结直肠癌 (CRC) 患者和健康个体的肠道微生物群,确定了特定的细菌物种,蛋白质和胆酸代谢物,可以作为CRC的诊断生物标志物.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 在瘤学瘤学.
- 生物化学 生物化学
背景情况:
- 结肠直肠癌 (CRC) 是一个重要的全球健康问题,受遗传学和环境因素的影响,特别是肠道微生物群.
- 人们越来越多地认识到肠道功能失调是CRC发展和进展的重要因素.
研究的目的:
- 为了比较CRC患者和健康对照者之间的肠道微生物组成.
- 为了确定在CRC患者中上调或下调的特定蛋白质和代谢物.
主要方法:
- 从CRC患者和健康对照的便样本使用下一代测序 (BGI DNBSEQ-T7) 进行了分析.
- 使用液体染色学-质谱/质谱 (LC-MS/MS) 进行了蛋白质学和代谢学分析.
主要成果:
- 与健康对照人群相比,CRC患者观察到肠道微生物群多样性的增加.
- 在CRC患者中观察到参与de novo核酸和氨基酸合成的途径的异常上调.
- 蛋白质组学和代谢学显示出显著的差异,360种蛋白质和158种在CRC患者中高度表达的代谢物,包括特定的胆酸代谢物,如牛和taurocholic acid.
结论:
- 某些细菌物种,蛋白质 (例如,转基托酶,碳酸无水酶) 和代谢物 (例如,胆酸) 显示出作为CRC诊断生物标志物的潜力.
- 多omics方法为肠道微生物群和结直肠癌之间的复杂关系提供了宝贵的见解.
