确定1q放大和PHF19表达的高风险细胞,与复发性/耐药性多发性髓瘤相关
Travis S Johnson1,2,3,4, Parvathi Sudha5, Enze Liu5
1Department of Biostatistics and Health Data Science, School of Medicine, Indiana University, Indianapolis, IN, USA.
Research square
|August 30, 2023
概括
研究人员确定了一种特定的血细胞亚型,称为复发性/耐药性血细胞 (RRPC),与多发性骨髓瘤进展有关. 这些RRPCs表现出高PHF19表达,并与治疗耐药性和不良结果有关.
科学领域:
- 血液学 血液学 血液学
- 在瘤学瘤学.
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 多发性骨髓瘤 (MM) 是一种无法治愈的血细胞癌,治疗选择有限.
- 对免疫调节药物 (iMiDs) 和蛋白酶体抑制剂 (PIs) 的治疗耐药性是MM管理的一个主要挑战.
- 之前的研究发现了与高风险MM相关的遗传和转录标记,包括PHF19,与高风险MM相关.
研究的目的:
- 用单细胞多组学来描述复发性/耐药性多发性髓瘤 (RRMM) 的细胞和分子格局.
- 为了确定新的细胞亚型和调控机制驱动MM进展和治疗耐药性.
- 调查PHF19在MM病变发生过程中的作用.
主要方法:
- 创建一个大规模的单细胞多原子数据集 (325,025个细胞,49名患者),整合ATAC-seq和RNA-seq.
- 匹配的全基因组测序 (WGS) 用于患者的基因组分析.
- 生物信息分析用于识别细胞亚型,基因组改变和基因表达模式.
主要成果:
- 鉴定了一种独特的血细胞亚型,复发/耐药血细胞 (RRPCs),与MM进展相关.
- RRPCs表现出特有的1q变异,TP53突变和PHF19表达的升高.
- 观察到细胞循环抑制剂的下游调节和转录因子PBX1在RRPC中的潜在参与.
结论:
- PHF19在RRPCs和MM进展的生物学中发挥着重要作用.
- 已识别的RRPC亚型代表了理解和克服MM治疗耐药性的关键目标.
- 单细胞多组学为多发性骨髓瘤的异质性和演变提供了强大的洞察力.
