使用绝对qPCR对小麦,西红和的树状菌根菌根殖民的量化
Andrea Corona Ramírez1, Sarah Symanczik1, Tabea Gallusser1
1Department of Soil Sciences, Research Institute of Organic Agriculture FiBL, Frick, Switzerland.
Mycorrhiza
|August 30, 2023
概括
定量PCR (qPCR) 提供了一种可靠的高通量方法,用于评估状菌根真菌 (AMF) 根植殖. 这项研究通过显微镜验证了qPCR绝对量化,在小麦和西红中发现了强烈的相关性,但没有子,强调了作物特定的原料验证.
科学领域:
- 植物科学 植物科学
- 菌类学 菌类学是指菌类学.
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 树枝状菌根真菌 (AMF) 与陆地植物形成关键的共生,增强生长和健康.
- 评估AMF根植殖的传统方法,如显微镜,是艰苦和主观的.
- 定量聚合酶连锁反应 (qPCR) 为量化AMF殖民提供了一个可靠的,高通量替代方案.
研究的目的:
- 为了验证使用AMG1F和AM1初始对来评估AMF根植入的绝对量化qPCR方法.
- 将qPCR绝对量化结果与不同作物种的传统显微镜方法进行比较.
- 为了确定经过验证的qPCR方法的特定作物的适用性.
主要方法:
- 使用AMG1F和AM1初始对进行绝对定量化qPCR.
- 来自小麦的根样 (cv. 科尔梅塔和维瓦),西红和子进行了分析.
- qPCR结果与传统的根染色和显微镜观察进行了比较.
主要成果:
- 对小麦 (Colmetta:r=0.90;Wiwa:r=0.94) 和西红 (r=0.93) 的显微镜和qPCR之间观察到强烈的正相关性.
- 没有发现显微镜和qPCR之间的显著相关性为李克 (r=0.27).
- 这些发现表明,初级配对的性能可能取决于作物.
结论:
- 绝对量化qPCR是一种强大而有效的方法,用于评估小麦和西红等作物中的AMF根植入.
- 这项研究强调,在广泛应用之前,需要对特定作物物种进行初级对的验证.
- 可能需要进一步的研究来优化qPCR协议,以适应像鱼这样的反抗性物种.
