关于使用基于eDNA的针对性检测稀有动物物种的现状和热点问题
Sofia Duarte1, Luara Simões1, Filipe O Costa1
1Centre of Molecular and Environmental Biology (CBMA) and ARNET-Aquatic Research Network, Department of Biology, University of Minho, Campus de Gualtar, 4710-057 Braga, Portugal; Institute of Science and Innovation for Bio-Sustainability (IB-S), University of Minho, Campus de Gualtar, 4710-057 Braga, Portugal.
The Science of the total environment
|August 30, 2023
概括
环境DNA (eDNA) 方法有效地检测罕见和入侵的动物物种. 这篇评论强调了eDNA的重点.
科学领域:
- 环境DNA (eDNA) 分析
- 分子生态学分子生态学
- 生物多样性监测 生物多样性监测
背景情况:
- 电子DNA对于检测罕见,危和入侵性动物物种至关重要.
- 分子进化原理是eDNA工具开发的基础.
- 对使用eDNA检测向动物物种的549篇出版物 (2008-2022) 进行了全面的审查.
研究的目的:
- 审查基于eDNA的方法用于目标动物物种检测的应用.
- 确定eDNA研究的趋势,包括被调查的生态系统,目标种群和分子标记物.
- 突出 eDNA 测试开发领域的局限性和未来研究领域.
主要方法:
- 对549篇出版物 (2008-2022) 的系统文献综述.
- 对调查的生态系统 (水生,陆生),目标物种 (脊椎动物,无脊椎动物) 和分子标记物 (Cytb,COI) 的分析.
- 评估使用的分子方法 (qPCR,元编码).
主要成果:
- 水生生态系统,特别是淡水 (74%) 是最受调查的.
- 在脊椎动物中,鱼类 (38%) 和危物种是主要目标;在无脊椎动物中,软体动物和甲类 (21%) 是主要目标,通常用于入侵物种.
- 定量PCR (qPCR) 是主要的方法 (75%),而eDNA元编码很少用于单个物种的检测 (约. 只有一个人 (6%).
结论:
- 电子DNA方法是有效的检测目标动物物种,特别是在水生环境.
- 当前的研究往往忽略了环境因素,DNA脱落率和标记器灵敏度,影响了试验准确性.
- 未来的eDNA测试开发需要强大的遗传数据,特异性测试和考虑地理变异,以最大限度地减少假负和假阳性.


