完整基因组测序和比较基因组表征blaNDM-5携带Citrobacter freundii分离物从一个患有多种感染的患者
Jianzhong Ye1, Lulu Jin2, Yaling Li3
1Department of Clinical Laboratory, Key Laboratory of Clinical Laboratory Diagnosis and Translational Research of Zhejiang Province, the First Affiliated Hospital of Wenzhou Medical University, Nanbaixiang Street, Ouhai District, Wenzhou, 325000, Zhejiang Province, China.
这项研究报告了首次对携带Citrobacter freundii分离物的blaNDM-5进行了鉴定,该分离物来自一个患有多种感染的患者. 这些多药耐药细菌在IncX3等离子体上具有可转移的NDM-5基因,突出显示了严重的公共卫生问题.
科学领域:
- 临床微生物学和传染病.
- 抗微生物耐药性的基因组学和分子流行病学.
背景情况:
- 碳酶产生肠道细菌 (CPE) 是一个全球性的健康威胁.
- 临床相关的产生卡巴酶的Citrobacter导致多种感染很少被研究.
- 这项研究侧重于blaNDM-5携带Citrobacter freundii分离物,来自患有血液和尿路感染的患者.
研究的目的:
- 报告携带Citrobacter freundii的blaNDM-5的隔离和比较基因组学.
- 调查这些分离物的遗传关系和耐药性机制.
- 为了评估blaNDM-5基因的水平转移性.
主要方法:
- 对C. freundii分离物进行了抗菌敏感性测试 (AST).
- 通过使用修改的卡巴胺失活方法 (mCIM和eCIM) 检测到金属碳烯酶的产生.
- 基因型定型,比较基因组学和等离子体分析,包括PCR和测序,用于描述分离物和blaNDM-5基因的位置和结构.
主要成果:
- 这两种C. freundii分离物都具有多药性耐药性,并被证实为blaNDM-5阳性金属碳酶生产物.
- 对比基因组学揭示了分离物之间的高度遗传相似性.
- blaNDM-5基因位于可转移的IncX3等离子体上,并且表现出保存的结构上下文.
结论:
- blaNDM-5等离子体表现出显著的水平转移能力.
- 产生NDM-5的C. freundii分离物需要在临床监测中密切关注.
- 这是第一个从一个患有多种感染的患者中携带blaNDM-5的C. freundii菌株的研究.
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