定量SARS-CoV-2亚基因组RNA作为病毒感染性的替代标记:培养分离和直接sgRNA量化之间的比较

科学领域:

• 病毒学 病毒学
• 传染性疾病 传染性疾病
• 分子诊断学 分子诊断

背景情况:

• 亚基因组 (sg) SARS-CoV-2 RNAs 是病毒传染性的潜在指标.
• 关于sgRNA负载与有活力的SARS-CoV-2病毒存在之间的相关性,数据有限.

研究的目的:

• 为了确定SARS-CoV-2培养分离和E和N sgRNAs的量化之间的一致性.
• 评估sgRNA试验作为活跃SARS-CoV-2感染的替代标记.

主要方法:

• 从住院的SARS-CoV-2患者中分析了51个鼻抽样.
• 使用滴滴数字PCR (ddPCR) 量化E和N sgRNAs.
• 将ddPCR结果与SARS-CoV-2培养分离结果进行比较.

主要成果:

• E和N sgRNA测定显示出高灵敏度 (100%和84%) 和特异性 (100%和86%) 预测培养积极性.
• 对E和NsgRNA的最佳切断值分别为32和161副本/毫升,具有高的诊断准确性 (88%和92%).
• 处于或高于切断值的sgRNA水平的患者显示出更中度/严重的疾病和更短的症状持续时间的趋势.

结论:

• SARS-CoV-2 sgRNA量化是估计病毒复制活性的一个有价值的工具.
• sgRNA测试可以作为可靠的代用标记,用于识别活跃SARS-CoV-2感染的患者.
• 将sgRNA检测集成到诊断工作流程中,可以改善易受伤害的患者的监测和管理.