猪肉切片和尸体形态特征的基因剖析和基因组预测
Lei Xie1, Jiangtao Qin1, Lin Rao1
1State Key Laboratory for Pig Genetic Improvement and Production Technology, Jiangxi Agricultural University, Nanchang, 330045, China.
Journal of animal science and biotechnology
|September 2, 2023
概括
研究人员确定了猪肉切片的14个QTL,有助于为更高价值的品种选择. 基因组估计品种值 (GEBVs) 显示预测准确度高达0.693,其中关键的切割,如肋骨和小腿,表现强.
科学领域:
- 动物遗传学动物遗传学
- 量化遗传学 量化遗传学
- 畜牧养殖 畜牧养殖 畜牧养殖
背景情况:
- 越来越多的预先切割的猪肉需求需要了解猪肉切割的遗传基础.
- 之前的研究集中在表型和遗传参数上,忽视了猪肉切片的定量特征位点 (QTL).
- 这项研究通过确定QTL和评估17个猪肉切片的基因组估计品种值 (GEBV) 来解决这一差距.
研究的目的:
- 为了确定影响猪肉切割特征的QTLs.
- 为了评估猪肉切片的GEBV的准确性.
- 为了提供对生猪育种中标记辅助和基因组选择的见解.
主要方法:
- 在使用CC1 PorcineSNP50 BeadChips的四个种群中对2,012头猪进行基因定型.
- 全基因组关联研究 (GWAS) 使用单元型和归算基因型来识别QTLs.
- 用调整的表型和GEBVs之间的相关性来计算GEBVs的预测准确性.
主要成果:
- 通过GWAS通过17个猪肉切片识别了14个QTL和112个QTL.
- 基因HMGA1,VRTN和BMP2与身体长度和体重有关,影响骨和脊椎动物的特征.
- 猪肉切片的GEBV预测准确度从0.342到0.693不等,肋骨,无骨野餐肩膀,细腿,后腿骨和肩膀骨超过0.600.
- 通过先进的模型提高了预测准确性,增加了标记密度和标记预选.
结论:
- 这项研究是首次剖析猪肉切片的遗传机制,确定了许多重要的QTL和候选基因.
- 结果支持标记辅助和基因组选择,以改善猪肉切割特征.
- 建立了第一批用于猪肉切片的基因组选择的参考种群.
