一种多目标的计算药物发现方法,用于重新利用四环素对抗水病毒
Thamir A Alandijany1,2, Mai M El-Daly1,2, Ahmed M Tolah1,3
1Special Infectious Agents Unit-BSL3, King Fahd Medical Research Center, King Abdulaziz University, 21362, Jeddah, Saudi Arabia.
Scientific reports
|September 4, 2023
概括
重用四环素抗生素显示出治疗水的前景. 研究人员对16种四环环素进行了针对关键病毒标的选,确定了治疗水的强有力的候选药物.
科学领域:
- 病毒学 病毒学
- 药物发现 药物发现 药物发现
- 计算化学计算化学
背景情况:
- 病毒 (MPXV) 构成了严重的公共卫生威胁,治疗选择有限.
- 病毒复制蛋白是抗病毒药物开发的关键目标.
- 药物重定向提供了一条更快的途径来识别潜在的治疗方法.
研究的目的:
- 为了确定潜在的药物重用候选人用于水治疗.
- 为了选四环素抗生素对必不可少的MPXV病毒蛋白.
- 通过计算方法评估已识别的化合物的疗效.
主要方法:
- 针对两个MPXV标的16种四环素药物的高通量虚拟查:DNA依赖RNA聚合酶 (DdRp) 和病毒核心蛋白酶.
- 精选的蛋白质-连接体复合体的分子动力学模拟 (300 ns).
- 有约束力的免费能源计算 (MM/GBSA) 和主要组件分析 (PCA).
主要成果:
- 蒂格环素和埃拉瓦环素对DdRp具有很高的结合亲和力.
- 奥马达环素和米诺环素对病毒蛋白酶表现出强烈的结合.
- 分子动态和结合能分析证实了这些候选药物的稳定性和亲和力.
结论:
- 环素衍生的抗生素显示出作为水治疗药物重新利用的潜力.
- 已识别的化合物,如tigecycline,eravacycline,omadacycline和minocycline,是进一步调查的有希望的线索.
- 这项研究为开发新水治疗方法提供了计算基础.
