探索PP7病毒样粒子用于体显示的景观
Parisa Keshavarz-Joud1, Liangjun Zhao1, Daija Bobe2
1School of Chemistry and Biochemistry, Georgia Institute of Technology, Atlanta, Georgia 30306, United States.
ACS nano
|September 5, 2023
概括
病毒样颗粒 (VLP) 可以被设计成显示外来. 这项研究确定了成千上万的15-mer序列,与PP7二元囊组合相容,有利于水友和负电荷的氨基酸.
科学领域:
- 生物技术是生物技术.
- 结构生物学 结构生物学
- 蛋白质工程是指蛋白质工程.
背景情况:
- 自组装的病毒样粒子 (VLP) 提供了一个多功能平台,可以显示外来分子,因为它们具有适应性的囊蛋白.
- 之前的研究表明,在特定可访问区域的PP7二元VLP上,的显示成功.
- 了解组件对体修改的耐受性对于VLP工程至关重要.
研究的目的:
- 为了研究PP7二元囊蛋白对随机的15-mer插入和终端扩展的组装耐受性.
- 为了确定顺序偏好和限制,以成功组装VLP与表面显示.
- 扩大可以在PP7二极管VLP上显示的类的谱.
主要方法:
- 基于图书馆的方法的实施,使用随机的15-mer序列.
- 基于装配的选择的两轮代,以确定功能VLP序列.
- 深度测序分析以评估氨基酸偏好在显示的每个位置.
主要成果:
- 在组装能力强的VLPs中确定了对性和负电荷氨基酸 (Asp,Glu) 的明显偏好.
- 观察到有正电荷,体积庞大和疏水性氨基酸残留物 (Trp,Phe,Tyr,Cys) 的排除.
- 发现了4000到22000个独特的15-mer序列,这些序列在PP7二元体上成功显示.
结论:
- PP7二极体体蛋白显示出适应表面显示的特定序列偏好.
- 小的初始库可以产生大量的装配能力强的VLP序列.
- 这种基于图书馆的选择方法显著扩大了已知的可在核蛋白颗粒上显示的的多样性.
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