在大脑缺血症中识别m6A甲基化相关基因――基于生物信息学方法的Breviscapus疗法的再输液
Cheng Wan1, Jingchun Pei2, Dan Wang3
1Department of Interventional Radiology, The First Affiliated Hospital of Kunming Medical University, Kunming, Yunnan, 650032, China.
BMC medical genomics
|September 5, 2023
概括
布雷维斯卡平治疗脑缺血-再输血 (I/R) 损伤的治疗发现了四个关键基因:Tfcp2l1,Kcns3,Olfml2a和Arl4d. 这些基因对于理解breviscapine至关重要.
科学领域:
- 神经科学是一个神经科学.
- 分子生物学分子生物学
- 药理学 药理学是指药理学的学科.
背景情况:
- 大脑缺血-再输液 (I/R) 损伤导致神经元死亡延迟.
- 布雷维斯卡平在减轻微血管内皮细胞中I / R诱导的氧化损伤和亡方面显示出潜力.
- 布雷维斯卡神经保护作用的确切机制仍需要阐明.
研究的目的:
- 调查布雷维斯卡对大脑I/R损伤的保护作用背后的分子机制.
- 在I/R模型中识别由布雷维斯卡调节的关键基因和通路.
- 为布雷维斯卡在治疗I/R诱导的神经元损伤中的临床应用建立理论基础.
主要方法:
- 转录基因组测序用于控制,氧-葡萄糖剥夺/再氧化 (OGD/R) 和布雷维斯卡治疗 (治疗) 的小鼠模型.
- 进行了差异基因表达分析和与N6-甲基氨酸 (m6A) 甲基化相关的基因查.
- 使用药物标预测,途径分析 (GSEA,IPA) 和circRNA-miRNA-mRNA网络构建来确定关键的监管元素.
主要成果:
- 在OGD/R和对照组之间共发现了2250个差异表达基因 (DEG),在治疗和OGD/R组之间发现了757个DEG.
- 确定了七个m6A相关的DEG,导致选择了四个关键基因:Tfcp2l1,Kcns3,Olfml2a和Arl4d.
- 途径分析表明,这些关键基因参与DNA修复,e2f目标和G2M检查点,Tfcp2l1与干细胞多能性有关. 一个circRNA-miRNA-mRNA网络突出了mmu_circ_0001258通过mmu-miR-301b-3p调节Tfcp2l1.
结论:
- 在OGD/R模型中,四个关键基因 (Tfcp2l1,Kcns3,Olfml2a,Arl4d) 与布雷维斯卡宾的治疗效果有显著的关联.
- 这些发现为未来的临床试验提供了关键的理论基础,用于调查布雷维斯卡宾对大脑I/R损伤的研究.
- 这项研究阐明了潜在的分子标和涉及布雷维斯卡神经保护作用的途径.
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