使用绑定配置文件映射抗体足迹
Asaf Azulay1,2, Liel Cohen-Lavi2,3, Lilach M Friedman1,2
1The Shraga Segal Department of Microbiology, Immunology and Genetics, Ben-Gurion University of the Negev, Beer-Sheva, Israel.
Cell reports methods
|September 6, 2023
概括
我们开发了一种使用抗体结合配置文件的高通量方法,以表征针对流感血质素 (HA) 的单克隆抗体 (mAbs). 这种方法,包括mAb-Patch工具,有效地预测抗体表位,并有助于选择mAbs进行进一步研究.
科学领域:
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 结构生物学 结构生物学
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 单克隆抗体 (mAbs) 在医学和生物学中至关重要.
- 对mAb结合表位的有效表征至关重要.
- 流感血凝素 (HA) 是抗体开发的关键标.
研究的目的:
- 开发一种使用绑定配置文件的高通量抗体足迹方法.
- 创建一个表位预测工具,mAb-Patch,基于结合数据和抗原结构.
- 描述抗流感血凝素 (HA) mAbs及其特异性.
主要方法:
- 利用抗原微阵列对23种抗流感HA mAbs进行分析,对抗43种流感菌株 (1918-2018) 的HA蛋白.
- 开发了mAb-Patch方法,将mAb结合配置文件与抗原3D结构集成在一起,用于表位预测.
- 使用已知HA结构的四个mAbs验证的mAb-Patch.
主要成果:
- mAb结合配置文件准确地描述了流感亚型的特异性,结合区域和结合部位.
- mAb-Patch成功识别了超过67%的真实表位在有限的抗原位置 (50-60).
- 证明了使用绑定配置文件来选和向下选择mAbs.概念的证明.
结论:
- 抗体结合配置文件为高通量表位特征提供了一个强大的策略.
- mAb-Patch提供了一种高效的计算工具,用于预测抗体表位.
- 这种方法有助于在流感研究中选择有前途的mAbs进行功能验证.
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