探索中国传统医学 (TCM) 数据库的化学空间,以利用分子查和模拟方法准来自病毒的I7L蛋白酶
A Khan1,2,3, M Shahab4, F Nasir5
1Department of Bioinformatics and Biological Statistics, School of Life Sciences and Biotechnology, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai, P.R. China.
SAR and QSAR in environmental research
|September 7, 2023
概括
这项研究选了传统中医药 (TCM) 对麻疹病毒 (mpox) I7L蛋白酶. 四种化合物显示出潜力,分子模拟证实了稳定的相互作用和比对照药物更高的结合能.
科学领域:
- 生物化学 生物化学
- 病毒学 病毒学
- 计算化学计算化学
背景情况:
- 病毒 (mpox) 构成了严重的公共卫生威胁.
- I7L蛋白酶是抗病毒疗法的潜在药物标.
- 传统中医 (TCM) 提供了丰富的潜在治疗化合物的来源.
研究的目的:
- 从TCM数据库中识别病毒 (mpox) I7L蛋白酶的潜在抑制剂.
- 通过分子查和模拟来评估已识别的化合物的药理潜力和结合相互作用.
主要方法:
- 对TCM数据库进行分子选,以确定潜在的I7L蛋白酶抑制剂.
- 分子动力学模拟以评估化合物-蛋白酶复合物的稳定性和结合相互作用.
- 绑定自由能量 (BF能量) 计算以量化绑定亲和关系.
主要成果:
- 与对照组相比,四种TCM化合物 (TCM27763,TCM33057,TCM34450,TCM31564) 显示出更高的药理潜力.
- 这些化合物向了I7L蛋白酶的关键残留物 (Trp168,Asn171,Arg196,Cys237,Ser240,Trp242,Glu325,Ser326,Cys328),这些残留物是I7L蛋白酶的关键残留物.
- 分子模拟表明TCM化合物具有稳定的复杂动力学,更紧密的包装和更高的平均键.
- BF的能量计算显示,所有已识别的TCM化合物都有有利的结合能量,其中TCM27763具有最高的亲和力.
结论:
- 已识别的TCM化合物显示出作为病毒 (mpox) I7L蛋白酶的新型抑制剂的显著潜力.
- 计算发现为进一步的实验验证和药物开发工作提供了坚实的基础.
- 这项研究强调了TCM在发现抗病毒药物对抗新兴传染病方面的价值.
