PubChemQC B3LYP/6-31G*//PM6 数据集:使用B3LYP/6-31G*计算的8600万个分子的电子结构
Maho Nakata1, Toshiyuki Maeda2
1RIKEN Cluster for Pioneering Research, 2-1 Hirosawa, Wako, Saitama 351-0198, Japan.
Journal of chemical information and modeling
|September 7, 2023
概括
这项研究展示了超过8500万个分子计算的电子特性的大数据集,为计算化学和药物发现研究提供了宝贵的资源.
科学领域:
- 计算化学计算化学
- 量子化学 是一个量子化学.
- 化学信息学 化学信息学
背景情况:
- 在PubChem化合物目录中包含了大量的分子,但它们的计算电子特性并不容易用于大规模分析.
- 获得全面的电子财产数据对于推动药物发现和材料科学等领域的发展至关重要.
研究的目的:
- 为PubChem Compound目录的很大一部分计算并提供大量,多样化的电子特性数据集.
- 为了使研究人员能够查询和利用这些分子属性用于各种科学应用.
主要方法:
- 使用B3LYP/6-31G*和PM6量子化学方法进行属性计算.
- 收集了85,938,443个分子的数据,涵盖了广泛的元素和分子重量.
- 将数据组织成五个不同的子集,并以GAMESS,JSON和PostgreSQL格式提供.
主要成果:
- 产生了电子属性,包括数百万个分子的轨道,能量和双极时刻.
- 为最高占成的分子轨道-最低不占用的分子轨道能量差距实现了高的确定系数 (高达0.892).
- 截至2016年8月29日,该数据集占PubChem Compound目录的94.0%.
结论:
- PubChemQC B3LYP/6-31G*//PM6数据集为计算化学和化学信息学提供了宝贵的资源.
- 综合的电子财产数据促进了药物发现,材料科学和其他研究领域的应用.
- 数据可以在创意共享许可证下访问,促进开放的科学研究.
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