开发一个预后模型的阿诺基斯和识别肝细胞癌中枢基因
Zhiwei Zhong1, Fuchun Xie2, Jiajun Yin3
1Department of Infectious Disease, The Second Affiliated Hospital of Dalian Medical University, Dalian, 116023, People's Republic of China.
Scientific reports
|September 7, 2023
概括
这项研究开发了一种新的风险评分,使用九个与阿诺基斯相关的基因来预测肝细胞癌 (HCC) 患者的结果. 该模型识别了具有增加免疫细胞透率和潜在耐药性的高风险患者,提供了新的治疗策略.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 分子生物学分子生物学
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 肝细胞癌 (HCC) 的死亡率很高,目前的预后系统缺乏准确性.
- 阿诺基斯是一种编程细胞死亡形式,在癌症的进展和转移中发挥着作用.
研究的目的:
- 建立和验证基于阿诺基斯相关基因的新型风险评分模型,用于预测HCC患者的预后.
- 研究HCC中风险得分,免疫细胞透和药物敏感性之间的关系.
- 确定与HCC进展和患者结局相关的关键阿诺基斯相关基因.
主要方法:
- 利用LASSO回归来选择9个与阿诺基斯相关的基因,并构建一个风险评分模型.
- 使用ICGC数据集和Kaplan-Meier/ROC曲线分析验证了模型.
- 采用WGCNA分析来识别枢纽基因,并通过免疫组织化学和TCGA mRNA-Seq.评估基因表达.
主要成果:
- 开发的风险评分准确地预测了HCC患者的预后.
- 高风险患者表现出aDCs,巨细胞,T-状辅助细胞和Th2细胞的透增加,以及PD-L1表达的增加.
- BIRC5和SKP2被确定为枢纽基因,在HCC中表达过度,并与预后和临床特征不佳有关.
结论:
- 与阿诺基斯相关的风险模型改善了对HCC患者生存结果的预测.
- 该模型提供了免疫疗法和管理HCC药物耐药性的潜在治疗策略.
- BIRC5和SKP2是有关HCC进展的基因相关途径的关键枢纽基因.
