机器人工作流程用于自动化的长期适应性实验室进化:改善Corynebacterium glutamicum的乙醇利用
Lars Halle1,2, Niels Hollmann1, Niklas Tenhaef1
1Institute of Bio- and Geosciences, Forschungszentrum Jülich GmbH, IBG-1: Biotechnology, 52425, Jülich, Germany.
Microbial cell factories
|September 7, 2023
概括
使用自动重复批次培养 (rbALE) 的适应性实验室进化 (ALE) 在Corynebacterium glutamicum中显著提高了乙醇利用率. 在乙甲脱酶基因上游的一个单核酸变异被确定为这一改进的关键.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 合成生物学 合成生物学
- 代谢工程是代谢工程.
背景情况:
- 适应性实验室进化 (ALE) 是微生物菌株工程和基因组学的强大技术.
- ALE非常适合微生物适应新的环境和基板.
- 长时间ALE实验需要频繁的细胞增殖,理想情况下没有持续时间限制.
研究的目的:
- 开发一种扩展的机器人工作流程,用于使用自动重复批次培养 (rbALE) 的长期进化实验.
- 使用已建立的rbALE工作流程,改善Corynebacterium glutamicum中的乙醇利用率.
- 为了确定对增强乙醇同化负责的遗传修饰.
主要方法:
- 在微生物反应器系统中实施完全自动化的重复批次培养 (rbALE) 工作流.
- 采用微型板回收方法,用于无限批量培养和细胞代.
- 进行基因组测序和再工程,以确定关键的遗传变异.
主要成果:
- 在rbALE工作流程成功地改善了Corynebacterium glutamicum中的乙醇利用率.
- 演化后的菌株 (WT_EtOH-Evo) 的乙醇吸收和生长率显著提高.
- 通过影响GlxR结合和ALDH合成,单核酸脱酶 (ALDH) 基因上游的单核酸变异被确定为加强乙醇同化至关重要.
结论:
- 开发的rbALE技术广泛适用于各种微生物菌株和选择压力.
- 这些发现使得使用C. glutamicum与乙醇作为基质的生产过程可以得到改进.
- 这一进步对于制造由乙-CoA衍生的产品尤为重要.
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