在动态固体相上进行高吞吐量提取,以从生物样本中分离低丰度生物标志物

科学领域:

• 生物技术是生物技术.
• 分子生物学分子生物学
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• 液体活检,特别是循环瘤DNA (ctDNA) 分析,为癌症管理提供了一种非侵入性方法.
• 从血清等复杂的生物矩阵中有效地提取ctDNA,对于准确的分析至关重要.
• 现有的方法在特异性方面面临挑战,并尽量减少目标遗传物质的损失.

研究的目的:

• 开发和验证一种新的微流体流化床系统,用于增强ctDNA提取和预度.
• 通过利用流速波动和混合珠子大小来优化捕获效率.
• 建立一种选择性捕获和检测患者血清中突变的BRAFDNA序列的方法.

主要方法:

• 开发新一代带有振动系统的微流体流化床 (FB).
• 使用不同的珠子大小的混合物来提高珠子的均性和捕获效率.
• 使用磁性FB用于选择性捕获双链 (dsDNA) BRAF突变DNA序列.
• 结合链反应 (LCR) 试验用于放大和检测目标DNA序列.

主要成果:

• 从人体血清中提取并预先缩特定的ctDNA序列,其流量高达15μL/分钟.
• 通过振动诱导的流速波动和混合的珠子大小,显著提高了珠子的均性和捕获效率.
• 成功开发了一种从患者血清中选择性捕获突变BRAFdDNA的方法.
• 通过LCR测定,通过低至6 × 10^4副本/μL的度检测到突变的BRAF DNA序列.

结论:

• 开发的微流体流化床系统为从血清中提取ctDNA提供了高通量,高效和特定的方法.
• 这项技术通过能够灵敏地检测特定突变来推进非侵入性癌症诊断.
• 该方法有望通过液体活检改善癌症诊断,治疗选择和患者监测.