作为 Alternaria 分类的替代工具的 SRAP 标记
E Castañares1, M I Dinolfo1, A Patriarca2
1Laboratorio de Biología Funcional y Biotecnología (BIOLAB)-CICBA-INBIOTEC-CONICET, Facultad de Agronomía, UNCPBA, Av. República de Italia 780, Azul, 7300, Buenos Aires, Argentina.
Food microbiology
|September 9, 2023
概括
序列相关放大多态 (SRAP) 标记器提供了一种具有成本效益的方法,用于识别大麦粒中的菌污染物,如Alternaria. 这项研究证明了SRAP.
科学领域:
- 菌类学 菌类学是指菌类学.
- 植物病理学 植物病理学
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 替代物种是全球谷物谷物的重要真菌污染物,产生对人类和动物健康有害的真菌毒素.
- 对于Alternaria物种复杂表征的传统和多相方法有时在形态,分子和化学分类学分类之间产生不一致的结果.
研究的目的:
- 评估序列相关放大多态 (SRAP) 标记,作为一种具有成本效益的工具,用于识别来自阿根廷大麦的Alternaria物种群.
- 为了比较SRAP标记器实用性与传统的形态学,遗传学和代谢物分析方法.
主要方法:
- 来自阿根廷大麦谷物的53个Alternaria分离物使用四种SRAP标记物组合进行了分析.
- 用UPGMA树状图和简单匹配相似系数分析数据,以生成一个家族遗传树.
主要成果:
- SRAP标记器成功将Alternaria分为三个不同的组,与以前的多相方法保持一致,包括Alternaria和Infectoriae部分的分化.
- *A. arborescens*的分离物明显地从*A. tenuissima*和*A. alternata*中聚集在一起,形成了一个单一的群.
结论:
- SRAP标记器是一种可靠,简单和具有成本效益的分子工具,用于分类Alternaria分离物.
- 这种方法为真菌识别提供了有价值的替代方案,特别是在资源有限的环境中.


