整体转录组分析犬类染细胞瘤和偏角细胞瘤
Marit F van den Berg1, Hans S Kooistra1, Guy C M Grinwis2
1Department of Clinical Sciences, Faculty of Veterinary Medicine, Utrecht University, Utrecht, Netherlands.
Frontiers in veterinary science
|September 11, 2023
概括
与正常组织相比,狗染细胞瘤和偏角细胞瘤 (PPGLs) 显示出不同的基因表达特征. 这项研究确定了潜在的治疗点,如RET,DRD2和SFRP2,并揭示了两个具有不同生存结果的PPGL亚型.
科学领域:
- 比较性瘤学研究
- 神经内分泌瘤基因组学
- 兽医病理学 兽医病理学
背景情况:
- 乳色细胞瘤和偏角细胞瘤 (PPGLs) 是神经内分泌瘤,治疗选择有限.
- 手术切除是有效的,但由于瘤的特征,通常会被排除在外.
- 对于PPGLs来说,急需新的治疗策略.
研究的目的:
- 通过转录基因分析识别驱动犬类PPGL发育的可用药物途径.
- 为了比较狗PPGLs的基因表达特征与正常的上腺髓.
- 发现潜在的治疗点,了解PPGL异质性.
主要方法:
- 对犬类PPGLs (n=19) 和正常上腺髓 (NAMs; n=10) 进行了RNA测序.
- 使用了差异基因表达分析和主要成分分析 (PCA).
- 基因表达模式与临床数据相关,包括Ki67得分和生存时间.
主要成果:
- 在PPGLs和NAMs之间,有4,218个基因被差别表达.
- PPGLs显示了与细胞周期,瘤进展,缺氧,血管生成和Wnt信号传递相关的基因的表达增加.
- 被确定为潜在的治疗标的关键过度表达的基因包括RET,DRD2和SFRP2. 在两个不同的PPGL组之一中,类蛋白 (PTN) 与侵略性表型和更短的存活时间相关.
结论:
- 这项研究阐明了犬类PPGL的转录基因格局,提供了对瘤病原学的见解.
- 已发现的RET,DRD2和SFRP2等基因为新型PPGL疗法提供了有前途的标.
- 确定了两个转录上不同的PPGL组,与生存率的显著差异相关.
