自动化微阵列平台用于单细胞分类和收集艾滋病毒再激活后的淋巴细胞

科学领域:

• 病毒学 病毒学
• 免疫学 免疫学 免疫学
• 细胞生物学 细胞生物学

背景情况:

• 艾滋病毒治愈策略包括使用潜伏逆转剂 (LRAs) 重新激活潜伏病毒,并消除受感染的细胞.
• 不完整和异质的病毒再激活限制了艾滋病毒根除策略的有效性.
• 在单细胞水平上了解HIV复激活的机制对于治疗成功至关重要.

研究的目的:

• 开发和利用在病毒再激活过程中对单个HIV感染细胞进行时间跟踪和分子分析的方法.
• 研究针对不同LRAs的T淋巴细胞HIV复激活动态的异质性.

主要方法:

• 微型飞机阵列被用来图像T淋巴细胞工程来表达mCherry在HIV长终端重复 (LTR) 促销器下.
• 细胞用LRAs (前列腺素,iBET151,SAHA) 进行治疗,并随着时间的推移监测mCherry光.
• 单细胞RNA测序在被排序的快速和缓慢的活性T淋巴细胞上进行.

主要成果:

• 微飞机阵列能够对超过25,000个单细胞进行成像,揭示了异质的活性化动力学.
• LRA诱导的mCherry表达细胞的百分比不同 (前列腺素: 30.5%,IBET151: 11.2%,SAHA: 12.1%).
• 单细胞RNA测序在快速和缓慢的活性化子群中确定了不同的基因表达特征,包括与炎症和免疫激活相关的基因.

结论:

• 这项研究强调了针对不同LRAs的HIV再激活动态中单细胞异质性的显著性.
• 开发的微型飞船阵列方法允许对病毒再激活进行详细的时间和分子表征.
• 识别不同的细胞反应为优化基于LRA的HIV治疗策略提供了洞察力.