循环介导的异热放大作为分子诊断试验:用于检测输血性大肠杆菌 (O157:H7) 的应用和评估

科学领域:

• 微生物学 微生物学
• 分子诊断学 分子诊断
• 公共卫生 公共卫生

背景情况:

• 肠出血性大肠杆菌 (Escherichia coli) (EHEC) O157:H7是导致食物传播疾病的重要原因之一.
• 快速准确的诊断方法对于控制EHEC疫情至关重要.
• 在资源有限的环境中,现有的诊断方法可能是有限的.

研究的目的:

• 评估循环介导同热放大 (LAMP) 试验用于检测EHEC O157:H7.7的性能.
• 评估针对Z3276基因的LAMP试验的特异性和敏感性.
• 为了将LAMP测定与传统的聚合酶链反应 (PCR) 和其他方法进行比较.

主要方法:

• 使用40种细菌分离物优化和评估了LAMP试验,包括EHEC O157:H7,其他E. 大肠杆菌菌株,以及非E. coli菌株. 大肠杆菌的物种.
• 通过裸眼观察度和凝电泳,可视化了DNA放大.
• 计算了灵敏度,特异性和预测值. 测试性能与PCR进行了比较.

主要成果:

• 在LAMP测试显示高灵敏度 (100%) 和特异性 (97.05%) 的EHEC O157:H7检测.
• 该试验显示了100%的负值和85.7%的正值预测值.
• LAMP比传统PCR敏感10倍,并且与PCR结果具有很高的一致性 (k=0.97).

结论:

• 灯光测定是一种高效,快速和具有成本效益的方法,用于检测EHEC O157:H7.
• 它的性能与PCR和其他方法相当或优于PCR和其他方法.
• 对于资源有限的实验室来说,LAMP是一个合适的临床诊断测试.