评估在全州废水监测网络中量化SARS-CoV-2的实验室内部和实验室间变异性
Angela Davis1, Scott P Keely2, Nichole E Brinkman2
1Division of Environmental Health Sciences, College of Public Health, The Ohio State University, 1841 Neil Avenue, Columbus, OH 43210, USA.
Environmental science : water research & technology
|September 13, 2023
概括
废水监测有效追踪SARS-CoV-2的传播. 为恢复效率和流量进行调整,使实验室变异最小化,证实了其对公共卫生准备的价值.
科学领域:
- 环境科学环境科学
- 公共卫生 公共卫生
- 病毒学 病毒学
背景情况:
- 随着COVID-19的爆发,人们越来越需要有效的SARS-CoV-2监测.
- 废水监测成为社区病毒传播的关键早期预警系统.
- 俄俄州建立了一个由八个废水监测实验室组成的全州网络.
研究的目的:
- 为了描述SARS-CoV-2废水监测结果在不同实验室中的变异性.
- 确定影响遗传定量和实验室间差异的因素.
- 验证废水监测作为公共卫生工具.
主要方法:
- 在七个试验中,八个实验室在废水样本中量化了SARS-CoV-2 RNA和便指标病毒.
- 用尖尖的替代品来评估恢复效率.
- 统计模型根据回收效率,流量和便标志物正常化进行调整,以最大限度地减少差异.
主要成果:
- 实验室实现了SARS-CoV-2RNA目标的可重复量化,但恢复效率各不相同 (3-75%).
- 为回收效率和流量进行调整,大大降低了实验室间的差异.
- 便标记物正常化进一步解释了样本和测量变化.
- 在SARS-CoV-2RNA水平和COVID-19病例数量之间发现了统计学上显著的相关性.
结论:
- 污水监测是监测COVID-19等传染病的宝贵工具.
- 通过调整回收效率和流量来标准化数据分析对于实验室间比较至关重要.
- 多实验室合作提高了对新出现的传染病的公共卫生准备.
