教医学生使用超级计算机:个人反思

科学领域:

• 计算生物学 计算生物学
• 医疗信息学 医疗信息学
• 高性能计算 (HPC) 是一种高性能计算.

背景情况:

• 2016年,CompBioMed卓越中心启动了一项教育和培训计划.
• 该计划的起源是希望在超级计算方面教育医学学生.
• 它涉及实验研究人员,计算机科学家,临床医生和行业合作伙伴之间的合作.

研究的目的:

• 描述CompBioMed教育和培训计划在六年中的改进和交付.
• 以突出成功和挑战,在参与临床医生和生物医学研究人员与先进的计算.
• 提出解决方案,将具有有限计算经验的用户集成到 petascale 环境中.

主要方法:

• 一个整体的教育方法,由一个多学科的团队开发和交付.
• 根据实际经验,不断完善培训计划.
• 专注于弥合桌面计算和高性能计算之间的差距.

主要成果:

• 该计划成功地使多元化的用户社区与超级计算互动.
• 在培训临床医生和生物医学研究人员方面取得了重大进展.
• 在医学中采用先进计算的障碍已被确定并解决.

结论:

• 该CompBioMed教育和培训计划已经证明了将临床医生整合到HPC环境中的可行性.
• 需要持续努力,以克服医疗专业人员计算培训的剩余挑战.
• 未来的战略应侧重于生物医学计算的可持续和可扩展的教育举措.