通过GC/MS代谢学方法分析hsa-miR-145-5p和hsa-miR-203a-5p对Imatinib耐药K562细胞的抑制作用
Priyanka Singh1, Radheshyam Yadav1, Malkhey Verma2
1Department of Biochemistry, School of Basic Sciences, Central University of Punjab, Ghudda, Bathinda 151401, India.
Journal of the American Society for Mass Spectrometry
|September 14, 2023
概括
微RNAs hsa-miR-145-5p和hsa-miR-203a-5p可以通过改变细胞代谢来克服慢性髓性白血病 (CML) 中的伊马替尼抗性. hsa-miR-203a-5p在恢复耐药细胞的代谢概况方面表现出显著的疗效.
科学领域:
- 生物化学 生物化学
- 分子生物学分子生物学
- 在瘤学瘤学.
背景情况:
- 意马替尼 (IM) 耐药性在治疗慢性髓性白血病 (CML) 方面是一个重大挑战.
- 已确定hsa-miR-145-5p和hsa-miR-203a-5p是克服IM耐药性的潜在药物.
- 已经证明hsa-miR-203a-5p可以影响IM耐药细胞中的谷甲代谢.
研究的目的:
- 研究hsa-miR-145-5p或hsa-miR-203a-5p是否可以通过向IM抵抗性K562细胞的代谢概况来抵消IM抵抗.
主要方法:
- 使用气体染色体质谱法 (GC-MS) 对IM敏感,IM耐药和miR转染的IM耐药K562细胞进行代谢分析.
- 使用MetaboAnalyst 5.0进行途径分析,以识别丰富的代谢途径.
- 部分最小平方区分分析 (PLS-DA) 用于比较新陈代谢概况.
主要成果:
- GC-MS确定了75种主要代谢物,其中32种在所有样本中都是共同的. 丰富的途径包括葡萄糖代谢,脂肪酸生物合成,脂质生成和核酸代谢.
- 十一个关键代谢物 (l-glutamine,l-glutamic acid,l-lactic acid,phosphoric acid,9,12-octadecadienoic acid,9-octadecenoic acid,myristic acid,palmitic acid,胆固醇和β-alanine) 在IM耐药细胞中增加了.
- 通过hsa-miR-145-5p或hsa-miR-203a-5p转移降低了这些升高的代谢物水平. hsa-miR-203a-5p表现出卓越的疗效,恢复与IM敏感细胞相似的代谢概况.
结论:
- 基于GC-MS的代谢分析可以有效地区分IM敏感细胞和IM耐药细胞.
- hsa-miR-145-5p和hsa-miR-203a-5p可以逆转与CML中IM抵抗相关的代谢变化.
- 通过监测治疗反应,hsa-miR-203a-5p具有显著的潜力,可以在耐药性CML患者中进行个性化治疗.
