向DNA甲基化分析促进了干血样本中的白细胞计数

科学领域:

• 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.
• 血液学 血液学 血液学
• 分子诊断学 分子诊断

背景情况:

• 细胞类型特定的DNA甲基化 (DNAm) 允许在血液中准确列出白细胞子集.
• 基于DNAm的细胞解适用于冷或干燥的血液,与依赖于形态或蛋白质表达的传统方法不同.
• 这项研究增强了针对性DNAm测定,以改善临床白细胞计数.

研究的目的:

• 改进DNA甲基化试验以在临床环境中精确计数白细胞.
• 通过使用数字滴滴PCR验证各种白细胞子集的DNAm-based deconvolution.
• 评估DNAm分析在干血样本上的有效性,用于自取样应用.

主要方法:

• 从40项研究中编译了DNAm资料,以使用CimpleG计算框架识别细胞类型特定的CG二核酸 (CpG).
• 通过从160名健康捐献者和150名患者的静脉血液中通过数字滴状PCR测量DNAm水平,确定了CPG.
• 用静脉和毛细血管血液样本进行验证的解密,包括在Whatman纸和Mitra微量采样设备上干燥的样本.

主要成果:

• 静脉血液中白细胞计数的表观遗传学估计显示,与自动细胞计数和流动细胞计量有很强的相关性 (例如,粒细胞r=0.95,淋巴细胞r=0.97).
• 对于干燥血液样本也观察到类似的高相关性和精度.
• 从干燥血液中绝对白细胞计数的表观遗传定量与传统测量 (静脉r=0.86,毛细血管r=0.80) 相关性良好.

结论:

• 细胞类型特异性CpG和数字滴滴PCR的高级选择提供了准确的表观遗传血液计数.
• 对干血样本的分析可以通过指针进行自我采样,从而提高了测试的可访问性.
• 这种表观遗传方法为白细胞计数提供了可靠的替代方案,特别是用于远程或自我管理的测试.