成熟的上心细胞的单细胞和空间异质性景观
Jianlin Du1, Xin Yuan2, Haijun Deng3
1Department of Cardiology, The Second Affiliated Hospital of Chongqing Medical University, Chongqing, 400010, China.
Journal of pharmaceutical analysis
|September 18, 2023
概括
通过先进的转录组分析确定了成熟的上心细胞的新基因标记物,包括MSLN和C3. 这些发现强调了细胞外矩阵信号在心脏再生中的作用.
科学领域:
- 发展生物学 发展生物学
- 心血管研究研究心血管研究
- 基因组学和转录基因组学
背景情况:
- 早期心上表皮发育是由TBX18,WT1和TCF21.21等基因标记的.
- 成熟的上心细胞的基因标记在很大程度上仍未被定义,这阻碍了对心脏发育和再生的理解.
研究的目的:
- 为了识别特定于成熟的上心细胞的新型基因标记物.
- 阐明细胞外矩阵信号在成熟的上心脏中的作用.
- 探索心脏再生的潜在治疗点.
主要方法:
- 使用Seurat,Monocle,CellphoneDB和Space Ranger进行了单细胞和空间转录组分析.
- 验证是通过免疫光学,全RNA in situ杂交和X-gal染色进行的.
- 伪性质分析被用来了解心表细胞在成熟过程中的命运.
主要成果:
- 空间转录学揭示了表心和非表心组织之间的明显特征.
- 确定了新的成熟表心标记物,包括MSLN,C3,EFEMP1和UPK3B.
- WT1,TBX18和UPK3B的表达一致,而MSLN,C3和EFEMP1的表达随着成熟而增加.
- 对UPK3B,MSLN,EFEMP1和C3阳性的心上细胞在细胞外矩阵信号通路中得到丰富.
结论:
- UPK3B,EFEMP1,MSLN和C3被确定为成熟上心脏的关键标志物.
- 细胞外矩阵信号传输在成熟的上心功能中起着至关重要的作用.
- 这些发现表明了心脏再生的潜在治疗途径.
