微生物的物种多样性以前通过DNA杂交方式被确定为非结核菌
Artem Victorovich Lyamin1, Danir Damirovich Ismatullin1, Maxim Olegovich Zolotov2
1Research and Educational Professional Center for Genetic and Laboratory Technologies, Samara State Medical University, Samara, Russia.
非结核菌 (NTM) 是一个越来越重要的机会性病原体. DNA杂交和MALDI-ToF质谱法有助于NTM识别,但需要标准化的隔离方法.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 临床诊断 临床诊断 临床诊断
- 细菌病原体的产生
背景情况:
- 顺序的机会主义细菌 Actinomycetales,特别是非结核菌 (NTM),具有越来越大的临床意义.
- 虽然Mycobacterium结核病复杂问题在很大程度上得到解决,但NTM由于其环境持久性而存在持续挑战.
- 结构性适应使NTM能够在各种环境中长期生存,使控制和治疗复杂化.
研究的目的:
- 评估和比较DNA杂交和MALDI-ToF质谱法用于识别NTM物种的有效性.
- 突出需要标准化的协议,从临床样本中分离Actinomycetales.
主要方法:
- 微生物是在固体蛋基上培养的,NTM的初步鉴定是使用DNA杂交.
- 通过使用矩阵辅助激光脱/离子化飞行时间 (MALDI-ToF) 质谱进行了进一步的识别.
- 重新鉴定涉及对纯培养的血和染色基质进行亚培养,所有分离物都通过MALDI-ToF进行分析.
主要成果:
- 通过DNA杂交,发现了188个菌株 (59.5%的总种植).
- MALDI-ToF质谱法被用于识别345种菌株.
- 这两种方法都证明在Actinomycetales顺序内的物种识别中有用.
结论:
- DNA杂交精确识别了常见的NTM物种.
- MALDI-ToF质谱法是识别大多数 Actinomycetales 物种的宝贵工具.
- 从临床材料中分离这些病原体的标准化算法对于改善诊断至关重要.
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