中枢神经系统中使用脑脊髓液测序下一代元基因组测序的诊断性表现 密码球菌使用脑脊髓液
Xuan Zhang1, Yaqing Lin2, Huixin Chen1
1State Key Laboratory for Diagnosis and Treatment of Infectious Diseases, National Clinical Research Center for Infectious Diseases, National Medical Center for Infectious Diseases, Collaborative Innovation Center for Diagnosis and Treatment of Infectious Diseases, the First Affiliated Hospital, Zhejiang University School of Medicine, Hangzhou, Zhejiang, People's Republic of China.
Infection and drug resistance
|September 19, 2023
概括
下一代元基因组测序 (mNGS) 有效地使用脑脊液 (CSF) 诊断中枢神经系统 (CNS) 密码菌. 然而,它的诊断灵敏度在以前用抗真菌药物治疗的患者中降低.
科学领域:
- 传染性疾病 传染性疾病
- 神经学 神经学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 中枢神经系统 (CNS) 密码球菌是一种严重的机会性感染.
- 甲基因组下一代测序 (mNGS) 是一种强大的病原体检测工具.
- 对于中枢神经系统密码菌病诊断的mNGS性能存在有限的数据.
研究的目的:
- 评估mNGS在脑脊液 (CSF) 中识别*Cryptococcus*物种的诊断效果.
- 为了比较mNGS性能与中枢神经系统密码菌病的常规诊断试验.
主要方法:
- 追溯分析来自疑似中枢神经系统感染的患者的25个脑脊髓样本.
- 将mNGS结果与印度墨水,加密球菌抗原 (CrAg) 测试和培养结果进行比较.
- 诊断性能的评估与或没有先前的抗真菌药物暴露.
主要成果:
- mNGS对中枢神经系统密码球菌病的检测显示出高灵敏度 (80.0%).
- 与 CrAg 检测和培养的一致率为 80.0%.
- 没有抗真菌暴露的患者 (100.0%) 的mNGS灵敏度明显高于暴露的患者 (50.0%).
- 这是Cryptococcus spp. 在抗真菌治疗前,读数显著更高.
结论:
- mNGS是一种有效的诊断工具,用于使用CSF的中枢神经系统密码菌.
- 抗真菌疗法显著降低了mNGS在检测*Cryptococcus* spp.中的敏感性.
